“自助通关”，是指持电子普通护照者，可以采用自助检查模式通关。也就是说，要想“自助通关”，前提是持有电子普通护照。
2012年5月15日起，全国公安机关出入境管理部门正式签发电子普通护照。电子普通护照是在传统本式普通护照中嵌入电子芯片，并在芯片中存储持照人个人基本资料以及面部肖像、指纹信息的新型本式证件。电子普通护照具有较强的数字防伪和物理防伪性能。眼下若新申请护照者，或持有传统本式普通护照者到期申请换发者，拿到的都是带有芯片的电子普通护照。
自助通关并不是刚刚兴起。早在2010年1月1日，浦东国际机场T2航站楼入境就正式启用了港澳旅客自助通关系统。当时系统主要适用于持有效《港澳居民来往内地通行证》的入境旅客，采用旅客自助检查模式，每位旅客平均通关时间不超过10秒，之后陆续在浦东机场和虹桥机场增设自助通关通道。2017年12月1日起，上海边检总站在浦东、虹桥国际机场口岸实施旅客出境自助通关，新增26条出境边检自助通关通道。2018年1月1日，上海边检总站在浦东机场口岸新增设21条出境自助通关通道。至此，上海机场口岸共拥有113条边检自助通关通道。其中浦东机场口岸设有50条入境、38条出境通道；虹桥机场口岸设有16条入境、9条出境通道。
需要提醒的是：并不是持有电子护照就一定能自助通关，比如直航台湾或澳门的旅客就不适用；机组人员也不适用。此外还有一些持港澳通行证往来港澳台地区者，能否自助通关，还与其签注及直航目的地有关。
自助出境很简便，旅客按照“扫登机牌、刷护照、按指纹拍照片”三个步骤，平均10多秒钟就可完成出境边检查验手续。具体来说，第一步：将登机牌放置在自助通关通道前端的登机牌扫描仪下方，系统自动识别搭乘的航班号；第二步：将本人持用的出入境证件放置在自助通关通道的证件阅读机上扫描，自助通关通道第一道门开启后进入通道；第三步：在第二道门前进行指纹和人像比对，通过后第二道门自动打开，旅客完成出境自助通关。
使用自助通关系统办理边检手续是免盖验讫章的。中国公民自助通关后有加盖验讫章需求者，尚未离开边检现场的，可以向边检人员提出补盖验讫章需求，由边检机关安排补盖；已离开边检现场的，可向当地公安机关出入境管理部门或边检机关查询出入境记录，出入境记录具有与边检验讫章相同的证明效力。
最后提醒广大旅客在使用自助通道过关时，一是要摘下墨镜正对摄像头拍照；二是要按压指纹。如指纹存在模糊、断纹等情况，导致系统无法识别、闸门无法打开等异常情况时，切忌硬推或翻越，以免引起不必要的误会，边检民警会随时在身边快速处理。此外，旅客如果出境走了传统通道，而入关时走了自助通道，那么护照上的出入境验讫章将不会配套成对出现，这种情况下护照仍可正常使用，旅客无需紧张。
